《假面骑士Amazons》讲述在某个城市中存在着不为人知的被称为Amazon的吞噬人类的异形的存在。它们的数量，竟达到4000只。制造出这个怪物的元凶是野座间制药，命令名下的野座间Peston Service驱除班秘密处理Amazon。就是在这种情况下，在清洁的房屋中一步也不出去的平稳生活着的青年水泽悠和只靠野生的直觉和战斗力的像野兽一样的活着的男人鹰山仁相识，慢慢懂得了在Amazons的激烈的生存斗争中生存下去的故事。